환자정보 등록/모니터링 웹서버 제작

관리 일지

  • 2019.04.01(월)
    • 논문 면담
      • 초록내용 임시작성
      • 당뇨 정보에 관련된 부분 (서론, 관련연구) 임시작성
      • 학습을 통해 혈당 변화추이를 보고 식사 예측하는 모델 개발요구
      • 시뮬레이션 데이터 / CGM 데이터 준비 x

  • 2019.03.25(월)
    • 변경된 지급금액 정상 입금 확인

  •  2019.03.18(월)
    • 논문 면담
      • 목차 정리 및 내용 틀 작성
      • 시뮬레이션 데이터와 관련된 ppt 자료와 연락처 전달

  •  2019.02.26(화)
    • CGM 과제 인건비 내역 수정
      • 현재 남은 지급금액 : 6,600,000
      • 12개월 655,000원씩 지급한다고 가정 시, 현재 실제 남아야 하는 금액 : 6,550,000
      • 남은 10개월은 개월당 655,000원이 아닌 660,000원씩 받을 경우 금액이 딱 일치함
        • 이한범 : 210,000
        • 김상현 : 200,000
        • 고한설 : 125,000
        • 김익환 : 125,000

  •  2019.01.23(수)
    • CGM 과제 인건비 확인
      • 학부생 14개월 10,000,000원
    • 11월 ~ 12월 과제 인건비 확인
      • 인원 : 배찬민, 김수아, 이한범, 김상현
      • 비용 : 11월, 12월 1,070,000
        • 배찬민 : 300,000
        • 김수아 : 200,000 (다른 연구과제로 인한 비용 감소)
        • 이한범 : 300,000
        • 김상현 : 270,000
    • 1월 과제 인건비 확인
      • 인원 : 이한범, 김상현
      • 비용 : 630,000 (고한설, 김익환 인원 추가되지 않은 상태)
        • 이한범 : 330,000
        • 김상현 : 300,000
    • 11월, 12월, 1월은 2019.01.25(금) 지급예정
      • 받은 비용중 10% 연구실 통장에 지급 확인필요
    • 2월 ~ 12월 과제 인건비 계획
      • 인원 : 이한범, 김상현, 고한설, 김익환
      • 비용 : 7,860,000 / 12 = 655,000 (단, 1월달 제외)
        • 이한범 : 210,000
        • 김상현 : 200,000
        • 고한설 : 120,000
        • 김익환 : 125,000
    • 필요문서
      • 재학증명서, 건강보험등록필증, 동의서, 통장 사본

  •  2019.01.17(목)
    • 차후 면담 일정 취소 : 19.01.22(화)

  • 2019.01.03 (수)
    • 일시 : 오후 06:00 ~ 08:00
    • 면담 내용
      • 과제 비용 지급에 관련 된 내용은 11월, 12월에 참여한 학생들 지급 예정. 일자 정확하지 않음
      • 환자 300명 데이터를 통한 혈당 예측 결과물 필요 ( ~ 01.22 (화) )
        • PH별 FFNN, LSTM
        • 환자 300명 데이터로 프로그램 구동 필요
      • 인슐린 투여 알고리즘에 대한 시각화 필요 ( ~ 01.22(화) )
    • 차후 일정
      • 2019.01.22 (화)  CGM 실무회의
      • 2019.02.07 (목) CGM 정기면담

  • 2018.11.28 (수)
    • 학년별 지시사항
      • 4학년 : 찬민, 수아 논문지 작성 진행. 3학년 일부 보조
      • 3학년 : 방학 중 공통 과제, 개인별 과제 진행 예정
        • 공통과제
          • CGM 과제 진행
            과제 진행 중 받는 비용 10% 연구실 통장으로
            12월 이후 4학년 2명 → 3학년 2명
          • 최종 주제 하나 : IoT + 빅데이터 + 딥러닝
        • 한범 : 작성한 논문 성능평가, 엘라스틱서치 안정화, MQTT 담당
        • 상현 : 웹 서버, Node-Red 위주 + 추후 개인면담 시 추가
        • 재철 : 딥러닝, 머신러닝 위주 학습 + 추후 개인면담시 추가
  • 2018.11.19 (월)
    • 연구 일정 : IRB 승인 일 ~ 2019.12.31 (약 14개월)
    • 연구목적
      1) 자동화 된 혈당 DB 구축
      2) 혈당 DB와 LSTM 기반 혈당패턴 예측모델 개발
      3) 클라우드 기반 위험혈당 알림 시스템 개발
      4) 인슐린 용량결정 지원 시스템 개발
    • 연구 대상자 인원 : 50명
    • 자세한 내용은 연구계획서 요약 프린트물 참조
    • 다음 면담일자 : 2019.01.03(목)

(구)연구 내용일지

 

  • 2018.12.03 (월)
    • 진행 중
      • 4학년 (찬민, 수아) 논문작성
        • 기존의 학회 논문에 RNN, LSTM 설명 부분 추가 (LSTM 구조 그림 첨부 예정)
        • 기존의 FFNN 적용 사례에 더해 LSTM 적용한 예측 정확도 (그래프 첨부 예정)
        • 서론과 이론적 배경을 보충하기 위해 병원 측에
          “일반인도 이해 가능할 정도로 당뇨병과 CGM 기기에 대한 정보를 정리해서 달라” 고 요청함
        • 기존 논문에서 목차 재배치 및 추가 중
        • 논문 제목 확정 필요
      • uci 데이터 전 처리 방식 검토
        • csv 파일로 저장할 때, column 이름을 어떻게 나누어 줄 것인가?
        • 어떤식으로 나누어 저장할 것인가?
    • 시험 내용
      • FFNN / LSTM 학습 진행 결과 ( JCHR, 병원데이터, JCHR + 병원데이터 케이스로 나누어 진행)
        • 공통된 문제점 : 저혈당 케이스가 압도적으로 부족하여 제대로 학습되지 않음.
        • 초록색 : 고혈당 케이스 붉은색 : 저혈당 케이스
      • uci 데이터 csv export
        • csv 파일 column 값 : Day, Date, Time, Timestamp, Sensor_Glucose, Sensor_Glucose_Value, Regular insulin, NPH insulin, UltraLente insulin
          현재 일부 환자데이터만 csv 파일 형태로 저장 중
        • < 예시 > 엘라스틱 서치 인덱싱 형태
        • < 예시 > csv 파일 저장 형태
          Day Date Time Timestamp Pre-breakfast post-breakfast Regular Insulin NPH Insulin UltraLente Insulin
          SUN 91-July-13 09:00 68554543 23 36
      • 차트 확인은 Highchart 사용
        • 현재 넣은 데이터를 차트로 모니터링 테스트 하였음
        • Highchart 중, 다른 차트 형태 모색 중
    • 서버 현황
      • Hadoop 클러스터
        • 현황 없음
      • Kafka 클러스터
        • 현황 없음

  • 2018.11.30 (금)
    • 진행 중
      • uci 데이터 전처리 후 엘라스틱 서치내에 인덱싱 및 csv 파일 로컬상에 export
        • 단, 보간작업이 아님
        • 재철, 한범
      • 위의 csv 데이터를 차트로 모니터링 가능한 프로그램, 라이브러리 모색
        • 빅데이터 R, Highchart
        • 상현, 한설
    • 당일 시험 내용
      • uci 데이터 인덱싱 프로그램 (Python 3) 수정
        • 아래와 같은 형태로 인덱싱하도록 수정
          Sensor Gloucose : [ { “식전 식후” : 혈당 수치} ]
    • 서버 현황
      • Hadoop 클러스터
        • 현황 없음
      • Kafka 클러스터
        • 엘라스틱 서치 내에 uci 데이터 저장
          index : uci_patient-1 ~ 70

  • 2018.11.21 (수)
    • 진행 중
      • UCI  사이트 데이터 전처리 작업 ( 약 70여개 )
        링크 : https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/diabetes, 해당 데이터들을 정의한 스키마에 맞추어 ES에 삽입
      • 익명화된 회원 정보 검색 기능 페이지를 기존 CGM 웹 서버에 추가
    • 당일 시험 내용
      • 현재 시험내용 없음
      • 2018.11.27(수) 세미나 이후 진행 내용 및 지침사항 추가 예정
    • 서버 현황
      • Hadoop 클러스터
        • slave 6 – uci 데이터를 포함하여 FFNN, LSTM 학습
          • 천안 순천향 병원 데이터
          • JCHR 데이터
          • 천안 순천향 병원 데이터 + JCHR 데이터
      • Kafka 클러스터
        • 엘리스틱 서치 내에 uci 데이터 저장
          index : unpreprocessed-uci_patient-1 ~ 70
        • uci 데이터 보간작업 데이터 (5분 단위로 쪼갠 데이터를 만듦) 추가 저장
          index : preprocessed-uci_patient-1 ~ 70